FBAの場合です。

在庫管理から「商品と出品を削除」して管理画面上から確認できなくても、

1:FBA返品可能期間内に返品されたのか、

2:行方不明のものが発見された？のか、

FBAに販売可能在庫があって、出品に紐づけられていないものがあった場合、

在庫管理画面の上に「出品のないFBA在庫」（※今うちではないので、正確な文言確認できませんが）的なものが表示されます。

弊社でも型落ち品売りきった時など過去にありましたが、管理画面では商品ページ消していてタイトルもなにも表示されず、どの商品か分からなかったので、とりあえず自社に戻してモノの状態を確認したことがあります。