皆様、ご回答・議論ありがとうございます。

Amazonにも問合せ入れて、以下のような回答がありました旨、ご報告します。
結局のところ、具体的な決済金額はセラー側ではわからないとのことです。
お客様第一のはずのAmazonが、不親切だなあ。

今後は、この内容をテンプレとして問合せ対応したいと思います。

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Amazonご担当者様

お問い合わせいただきました５％還元商品金額についてご案内いたします。

誠に恐れ入りますが、下記のヘルプページに記載の通りの仕様となりますため、出品者様から購入者様の購入金額は確認できない仕様となり、納品書も元の金額で表示されます。

▼よくあるご質問 (FAQ)

▼抜粋
購入者様には、5%が即時還元されます。
例えば、100円でご出品されている場合、キャッシュレス決済を行った購入者様は、95円を支払うことになります。
5円は、Amazonが一時負担し、後ほど補助金申請を行うことになります。

購入者様より、何故金額が異なるかについて問い合わせがくる場合は上記のご説明をお願いいたします。
その他、割引後の金額の確認方法やご意見等に関しましては、カスタマーサービスへ誘導いただきます様お願い申し上げます。

今後とも、Amazon.co.jpをよろしくお願いいたします。