注文管理と決算について

現在amazonとyahooショッピングで食品と日用品を販売しております。
当方も多少ながら注文が入るようになりました。
決算が近いのですが教えていただきたいのが標準課税と軽減税率が混ざった状態で販売しておりますが。注文情報を取り込んで自動的に仕分けしてくれるソフトなどあるのでしょうか？
現在税理士の指導ですべての注文をエクセルで転記して管理しており、とてもじゃないですが時間がかかりすぎて困っています。
もし複数のでサイトで販売しながら複数課税の商品を販売しているセラーさんがおられましたr、どのような管理をされているか教えてほしいです。