複数の商品をお持ちなら、プライム会員限定割引の商品とクーポンを設定する
商品に分けて比較テストを今回すれば良いように思いました。

というわけで、自分は比較テストをしたことがないので何とも言えないですが、
プライム会員限定割引とクーポンで表示のされ方など異なります。

プライム会員限定割引の特徴
・必ず値引きされる。
・手数料は不要
・「〇〇％ off」と表示される

クーポンの特徴
・お客さんがクーポンの利用を決める（利用されないことも多々あり）
・手数料がかかる（60円）←注文後にキャンセルされても手数料は戻ってこない
・設定により「〇〇％ off」「〇〇円 off」と表示が異なる

自分の認識ではこんなところでしょうか。
仮に3000円の商品を販売していたとして、「10％ off」と「300円 off」は
値引きとしては同じですが、何となく「300円 off」の方がインパクトがある
ように感じるものです。
（タウリン1g配合、スピーカー出力2Wよりも、タウリン1000mg配合、
スピーカー出力2000mWの方がすごいように感じる心理）

クーポンは通常時も多々利用しておりますが、利用率は50～60％くらいです。
これは商品というか客層にも依るんだと思いますが。

クーポンで気に入らないところは注文後にキャンセルされた場合で、
クーポン利用済みで手数料はかかるのに売り上げには貢献しない
ところでしょうか。

このような特徴を踏まえ、実際にプライム会員限定割引の商品や
クーポンが設定してある商品が、お客さま目線でどのように見えるか
確認し、どちらにするか決めれば良いのではないでしょうか？

自分は特に何も考えずにプライムーデーだからプライム会員限定割引を
設定しております。