ポイントセントラルのポイント設定のアカウントごとのポイントは
ポイントが 実装された当時から 当店も 機能していません。
(それまでは 在庫ファイルと価格と数量変更ファイルでポイントを設定していました)
ポイントセントラルで一括管理になったので 改善されたかと思いきや
全然ダメでした。

SKUごとにポイントを設定したい場合は
出品ごとのポイントから ファイルをDLしULするしか方法はないです。

DLしたファイルは テキストファイルなので

• 全選択しコピー⇒次にExcel貼り付けします。
  このファイルでは SKUとポイント％の項目しかないので
  SKUが分かっているなら ポイントの％を入力しULすれば
  ポイント無しの商品の設定が出来ます。
  ULする時はExcel形式⇒タブ区切りのテキストへ変換（保存後 拡張子をtsvに変更）

当店の場合 SKUごとにポイントを設定していますが
商品価格で0％と1％を設定している為
価格が載ってないこのファイルで把握する事が出来ません。
そこで

• 出品レポートをDLし これもExcelに落とします。
  Excelの出品レポートのSKUと価格をポイント設定のExcelファイルに貼り付けます。
  価格でソート(価格でフィルター)してから 1000円以下は0％、1000円以上は1％に設定してから
  価格のみを削除し出品ごとのポイントで
  テキストファイル(txt⇒tsvに書き換える)に変換してから ULしました。

これで 問題なく 価格毎にポイント設定出来ました。